肠道菌群与人体互利共同生存，同时肠道中好菌、坏菌、中性菌维持着动态平衡，一旦这种平衡关系被打破，就有可能会引起各种疾病的产生。特别是脂肪的摄取，很可能会杀死肠道好菌、引起坏菌滋生，提高代谢性疾病的风险。
人体的消化肠道内大约生长着1000多种的细菌、微生物，称为肠道微生物菌群，它们以人类摄取的膳食做为生存的养分，还具有促进营养素吸收、合成制造维生素以及酵素等功效。
肠道内的菌群大致上可以分成好菌、坏菌跟中性菌，基本上要让肠道的好菌多于坏菌、建立优势菌群，对于人体的健康会更有利。但是随着近十几年来，国人饮食结构的改变，日益西化的饮食习惯，加工食品、红肉与高脂肪饮食的摄取，都会让肠道菌群发生改变。
长期摄取高脂肪食物，会导致肠道的减少甚至消失，特别是双歧杆菌的数量明显减少，破坏肠道的防护罩;相反的，革兰氏阴性菌数量的大量增加，革兰氏阴性菌又以大肠杆菌为代表。
肠道优势菌群的死亡，容易导致免疫系统的过度反应，引起发炎性肠道疾病的产生。人体长期处于慢性炎症的症状，容易进一步引起胰岛素抵抗，最终导致肥胖、糖尿病等代谢性疾病的发生。
想要建立肠道优势菌群，除了少吃高脂肪食物跟红肉之类，多补充蔬菜水果等高纤维食物，以及益生菌保健食品，也有助于肠道好菌的生长，优化肠道菌群的组成，减少代谢性疾病的发生。